Útvar se zabývá výzkumnou, poradenskou, expertní a monitorovací činností v ochraně lesa před biotickými škodlivými činiteli a zabezpečuje činnost Lesní ochranné služby (LOS), v jejímž rámci probíhá např. testování biologické účinnosti přípravků a dalších prostředků na ochranu lesa a zpracovávání stanovisek k dotacím ve smyslu platné legislativy. Pracovníci útvaru se výzkumně podílí na řešení otázek spojených s problematikou významu hmyzu a hub v lesních ekosystémech. V další výzkumné činnosti se věnují např. studiu a optimalizaci efektivity obranných opatření proti vybraným škodlivým organizmům (např. lýkožroutu smrkovému, lýkožroutu severskému apod.) nebo jsou zapojení do řešení výzkumných aktivit jiných útvarů v rámci výzkumného ústavu (NAZV a další). Nedílnou složkou činnosti jednotlivých pracovníků útvaru je zapojení do plnění úkolů Lesní ochranné služby (LOS).
